MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015850	ATC	2	6	72500	72505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780807
1502	NC_015850	TGG	2	6	72510	72515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780807
1503	NC_015850	ATC	2	6	72536	72541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780807
1504	NC_015850	TGG	2	6	72543	72548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780807
1505	NC_015850	CGG	2	6	72563	72568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780807
1506	NC_015850	TGCC	2	8	72604	72611	0 %	25 %	25 %	50 %	340780807
1507	NC_015850	CAT	2	6	72628	72633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780807
1508	NC_015850	CGC	2	6	72646	72651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780807
1509	NC_015850	CGGTGC	2	12	72685	72696	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340780807
1510	NC_015850	GTGGCC	2	12	72719	72730	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340780807
1511	NC_015850	GGT	2	6	72731	72736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780807
1512	NC_015850	TCG	2	6	72738	72743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780807
1513	NC_015850	CGC	2	6	72803	72808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780807
1514	NC_015850	CGG	2	6	72812	72817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780807
1515	NC_015850	GCCC	2	8	72826	72833	0 %	0 %	25 %	75 %	340780807
1516	NC_015850	TGG	2	6	72894	72899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015850	ATG	2	6	72975	72980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780808
1518	NC_015850	CCG	2	6	72981	72986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780808
1519	NC_015850	GGC	3	9	73028	73036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780808
1520	NC_015850	GCGG	2	8	73037	73044	0 %	0 %	75 %	25 %	340780808
1521	NC_015850	AGG	2	6	73048	73053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780808
1522	NC_015850	CAG	2	6	73056	73061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780808
1523	NC_015850	GCA	2	6	73068	73073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780808
1524	NC_015850	GCC	2	6	73092	73097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780808
1525	NC_015850	GCGCC	2	10	73121	73130	0 %	0 %	40 %	60 %	340780808
1526	NC_015850	CAG	2	6	73182	73187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780808
1527	NC_015850	GCC	2	6	73188	73193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780808
1528	NC_015850	CGG	2	6	73201	73206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780808
1529	NC_015850	GGGC	2	8	73216	73223	0 %	0 %	75 %	25 %	340780808
1530	NC_015850	GAG	2	6	73224	73229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780808
1531	NC_015850	CGG	2	6	73285	73290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780808
1532	NC_015850	TTC	2	6	73305	73310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780808
1533	NC_015850	GCG	2	6	73339	73344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780808
1534	NC_015850	GC	3	6	73376	73381	0 %	0 %	50 %	50 %	340780808
1535	NC_015850	GACCA	2	10	73436	73445	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1536	NC_015850	GTG	2	6	73450	73455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015850	GCC	2	6	73585	73590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780809
1538	NC_015850	GGC	3	9	73678	73686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780809
1539	NC_015850	TCA	2	6	73725	73730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780809
1540	NC_015850	TCA	2	6	73749	73754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780809
1541	NC_015850	TCA	2	6	73785	73790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780809
1542	NC_015850	CAG	2	6	73849	73854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780809
1543	NC_015850	GGC	2	6	73864	73869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780809
1544	NC_015850	CGC	2	6	73915	73920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_015850	GC	3	6	73919	73924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_015850	GTG	2	6	73981	73986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780810
1547	NC_015850	TGG	3	9	73999	74007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780810
1548	NC_015850	C	6	6	74011	74016	0 %	0 %	0 %	100 %	340780810
1549	NC_015850	CGGA	2	8	74113	74120	25 %	0 %	50 %	25 %	340780810
1550	NC_015850	CAG	2	6	74152	74157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780810
1551	NC_015850	TGCG	2	8	74216	74223	0 %	25 %	50 %	25 %	340780810
1552	NC_015850	GCG	2	6	74247	74252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780810
1553	NC_015850	CCG	2	6	74313	74318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780810
1554	NC_015850	GGA	2	6	74331	74336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780810
1555	NC_015850	GAG	2	6	74386	74391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780810
1556	NC_015850	GC	3	6	74392	74397	0 %	0 %	50 %	50 %	340780810
1557	NC_015850	CGG	2	6	74429	74434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780810
1558	NC_015850	GCG	2	6	74442	74447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780810
1559	NC_015850	CAA	2	6	74448	74453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780810
1560	NC_015850	GCCAG	2	10	74528	74537	20 %	0 %	40 %	40 %	340780810
1561	NC_015850	GCA	2	6	74541	74546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780810
1562	NC_015850	CTG	2	6	74599	74604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780810
1563	NC_015850	CAG	2	6	74628	74633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780810
1564	NC_015850	CGG	2	6	74723	74728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780810
1565	NC_015850	GTG	2	6	74764	74769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780810
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1567	NC_015850	CGG	2	6	74874	74879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780810
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1572	NC_015850	TGC	2	6	75093	75098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780810
1573	NC_015850	TCG	2	6	75149	75154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780810
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1576	NC_015850	GC	3	6	75242	75247	0 %	0 %	50 %	50 %	340780810
1577	NC_015850	GC	3	6	75295	75300	0 %	0 %	50 %	50 %	340780810
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1581	NC_015850	TGG	2	6	75476	75481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780810
1582	NC_015850	GCC	2	6	75517	75522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_015850	AGGC	2	8	75562	75569	25 %	0 %	50 %	25 %	340780811
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1588	NC_015850	CACC	2	8	75813	75820	25 %	0 %	0 %	75 %	340780811
1589	NC_015850	GTC	2	6	75892	75897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780811
1590	NC_015850	CTT	2	6	75898	75903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780811
1591	NC_015850	GTC	2	6	75958	75963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780811
1592	NC_015850	GCG	2	6	76022	76027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780811
1593	NC_015850	CAT	2	6	76054	76059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780811
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1595	NC_015850	CGA	2	6	76299	76304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780811
1596	NC_015850	C	6	6	76311	76316	0 %	0 %	0 %	100 %	340780811
1597	NC_015850	ACG	2	6	76334	76339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780811
1598	NC_015850	CGTA	2	8	76364	76371	25 %	25 %	25 %	25 %	340780811
1599	NC_015850	GC	3	6	76397	76402	0 %	0 %	50 %	50 %	340780811
1600	NC_015850	CGA	2	6	76404	76409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780811
1601	NC_015850	CG	3	6	76443	76448	0 %	0 %	50 %	50 %	340780811
1602	NC_015850	CGG	2	6	76509	76514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_015850	CCG	2	6	76526	76531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780812
1604	NC_015850	CG	3	6	76585	76590	0 %	0 %	50 %	50 %	340780812
1605	NC_015850	CTC	2	6	76648	76653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780812
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1608	NC_015850	GCG	2	6	76705	76710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780812
1609	NC_015850	ACC	2	6	76757	76762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780812
1610	NC_015850	CGGG	2	8	76776	76783	0 %	0 %	75 %	25 %	340780812
1611	NC_015850	GCT	2	6	76834	76839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780812
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1613	NC_015850	GC	4	8	76892	76899	0 %	0 %	50 %	50 %	340780812
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1621	NC_015850	GCGG	2	8	77195	77202	0 %	0 %	75 %	25 %	340780812
1622	NC_015850	CAG	2	6	77203	77208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780812
1623	NC_015850	CGA	2	6	77290	77295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_015850	GCA	2	6	77328	77333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1626	NC_015850	GGC	2	6	77403	77408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780813
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1752	NC_015850	TGG	2	6	82897	82902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780817
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1863	NC_015850	GTC	2	6	87638	87643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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